Skype в пользовательском подкаталоге
Skype Официальный сайт
Распаковываем архив в подкаталог:
~/skype_static-<version>
Создаем ссылку
ln -s ~/skype_static-<version> ~/skype
для удобства обновления в будущем.
Создавая иконку для запуска указываем, что рабочий подкаталог должен быть ~/skype и соответственно сам бинарник ~ /skype/skype
Таким образом становится возможной нормальная русификация через настройки, иначе скайп не видит файлов локализации.